"Terwujudnya Desa Sepukur yang Maju, Mandiri, Sejahtera, dan Berdaya Saing dengan Berlandaskan Nilai Gotong Royong serta Kearifan Lokal."
Untuk mencapai visi tersebut, Pemerintah Desa Sepukur menetapkan misi sebagai berikut:
Meningkatkan kualitas pelayanan publik yang cepat, transparan, dan akuntabel guna mewujudkan tata kelola pemerintahan desa yang baik.
Mendorong pembangunan infrastruktur desa yang merata dan berkelanjutan demi mendukung pertumbuhan ekonomi serta peningkatan kesejahteraan masyarakat.
Mengembangkan potensi ekonomi masyarakat desa, termasuk sektor pertanian, perkebunan, UMKM, dan usaha kreatif, agar tercipta kemandirian desa.
Meningkatkan kualitas sumber daya manusia (SDM) melalui bidang pendidikan, kesehatan, keagamaan, dan pelatihan keterampilan.
Melestarikan budaya, tradisi, dan kearifan lokal sebagai identitas Desa Sepukur serta mengembangkan potensi wisata berbasis budaya dan alam.
Meningkatkan peran serta masyarakat dalam pembangunan melalui semangat gotong royong, musyawarah, dan partisipasi aktif seluruh elemen desa.
Mewujudkan lingkungan desa yang bersih, hijau, dan sehat dengan menjaga kelestarian alam serta pengelolaan sumber daya alam secara bijaksana.